MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 11282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007643	TGT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007643	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007643	GTC	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007643	CGGT	2	8	1942	1949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007643	GCCC	2	8	1984	1991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_007643	GCC	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007643	CCG	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_007643	GCC	2	6	3142	3147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007643	ACA	2	6	4342	4347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007643	AGA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007643	CGA	3	9	6801	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007643	CGCCCC	2	12	6879	6890	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_007643	CGG	2	6	6925	6930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007643	TTTG	2	8	6935	6942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007643	GGC	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007643	TGG	3	9	7009	7017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007643	TCG	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007643	TCC	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007643	T	6	6	7136	7141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007643	CGC	2	6	8673	8678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007643	GA	3	6	8688	8693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007643	C	6	6	8705	8710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_007643	TTTG	2	8	8746	8753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007643	T	6	6	9129	9134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007643	GAG	2	6	9158	9163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007643	CCG	2	6	9176	9181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007643	CGGG	2	8	9186	9193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007643	CT	3	6	9420	9425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007643	TTC	2	6	9454	9459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007643	GAA	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007643	AAG	2	6	9561	9566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007643	AAGGC	2	10	9619	9628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007643	GTG	2	6	10204	10209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007643	TGC	2	6	10285	10290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007643	CGG	2	6	10515	10520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007643	C	8	8	12039	12046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_007643	CGG	2	6	15965	15970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007643	TCAG	2	8	15975	15982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007643	CAT	2	6	16008	16013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007643	CGG	2	6	16026	16031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007643	TGG	2	6	16051	16056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007643	CGGT	2	8	16058	16065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007643	CCTC	2	8	16079	16086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_007643	GAC	2	6	16197	16202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007643	GCG	2	6	16865	16870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007643	CGG	2	6	16891	16896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007643	CGC	3	9	16953	16961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007643	G	6	6	16972	16977	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007643	CGG	2	6	16988	16993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007643	GCT	2	6	17107	17112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007643	T	7	7	17181	17187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007643	G	6	6	17229	17234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007643	TTGCG	2	10	17238	17247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007643	TCC	2	6	17272	17277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007643	GTT	2	6	17284	17289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007643	GCG	2	6	17304	17309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007643	CGGA	2	8	17323	17330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007643	GAAGG	2	10	17340	17349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007643	GCG	2	6	18410	18415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007643	CTCCG	2	10	18417	18426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_007643	GCG	2	6	18471	18476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007643	AAG	2	6	19419	19424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007643	TCT	2	6	19528	19533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007643	CGA	2	6	19537	19542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007643	GAAACG	2	12	19559	19570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007643	GCC	2	6	19599	19604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007643	GCC	2	6	19618	19623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007643	GGC	2	6	19624	19629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007643	CCG	2	6	19645	19650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_007643	CCA	2	6	19676	19681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007643	CCG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007643	CGC	2	6	25765	25770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007643	CCT	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007643	CGT	2	6	25809	25814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007643	GCG	2	6	26893	26898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007643	ATA	2	6	26926	26931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007643	GCG	3	9	26960	26968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007643	GCG	2	6	27078	27083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007643	CGT	3	9	27784	27792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007643	CCG	2	6	27831	27836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007643	C	7	7	27891	27897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_007643	GGA	2	6	27923	27928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007643	G	6	6	28330	28335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007643	GCC	2	6	28347	28352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007643	GGT	2	6	28393	28398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007643	CGC	2	6	28399	28404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007643	GAG	2	6	28439	28444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007643	CCA	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007643	TTTGG	2	10	29687	29696	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007643	CGCC	2	8	32364	32371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_007643	CGC	2	6	32378	32383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007643	CCG	3	9	32423	32431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007643	CGC	2	6	32444	32449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007643	GCG	2	6	32450	32455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007643	ATG	2	6	32513	32518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007643	T	6	6	32523	32528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007643	CGC	2	6	32608	32613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007643	TGA	2	6	32641	32646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007643	GAC	2	6	32679	32684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007643	AGA	2	6	32693	32698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007643	TGT	2	6	32724	32729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007643	TCC	3	9	32743	32751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007643	TCA	2	6	32776	32781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007643	CTC	2	6	32837	32842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007643	CCG	2	6	32843	32848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007643	GGATC	2	10	32849	32858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007643	AT	3	6	34736	34741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007643	GGT	2	6	34777	34782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007643	G	6	6	35764	35769	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007643	C	6	6	35776	35781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_007643	GGC	2	6	40436	40441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007643	GCG	2	6	40485	40490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007643	A	6	6	40967	40972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007643	CCGG	2	8	40985	40992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007643	CGC	2	6	41008	41013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007643	GGC	2	6	41037	41042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007643	CGGG	2	8	41064	41071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007643	GGC	2	6	41251	41256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007643	GGT	2	6	42025	42030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007643	G	6	6	43509	43514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007643	CCG	2	6	43536	43541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007643	GGA	2	6	43593	43598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007643	GGCG	2	8	43606	43613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007643	A	6	6	43614	43619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007643	GGC	2	6	43620	43625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007643	GCC	2	6	43663	43668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007643	GAA	2	6	43694	43699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007643	GCC	2	6	43700	43705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007643	AAG	2	6	43748	43753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007643	T	6	6	43799	43804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007643	GATC	2	8	44295	44302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007643	AC	3	6	44337	44342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007643	GGC	2	6	44343	44348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007643	TTC	2	6	44350	44355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007643	CAC	2	6	44386	44391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007643	G	8	8	44392	44399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007643	G	6	6	44477	44482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007643	GCG	2	6	44554	44559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007643	CGC	2	6	44565	44570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007643	CCG	2	6	44571	44576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007643	CGG	2	6	44605	44610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007643	G	7	7	45182	45188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007643	CGTC	2	8	45208	45215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007643	TTGCC	2	10	45222	45231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007643	CGC	2	6	45251	45256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007643	TTCC	2	8	45293	45300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007643	CG	3	6	45314	45319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007643	GA	3	6	45331	45336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007643	CAA	2	6	46523	46528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_007643	CCG	2	6	46844	46849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_007643	CGGCG	2	10	48692	48701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
154	NC_007643	AGC	2	6	50415	50420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_007643	GGC	2	6	57513	57518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_007643	CG	3	6	57632	57637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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185	NC_007643	GAG	2	6	58102	58107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_007643	TAA	2	6	97142	97147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007643	TGA	2	6	97157	97162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007643	CGG	2	6	97193	97198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_007643	ACC	2	6	97223	97228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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292	NC_007643	TCCC	2	8	98246	98253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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421	NC_007643	TAA	2	6	168699	168704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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